上海市人民政府、中国工程院合作委员会第三次会议于2004年5月11日下午在上海科学会堂思南楼召开，中国工程院副院长杜祥琬院士、上海市严隽琪副市长以及翁史烈院士等16位委员（4位委员因故缺席）出席了会议，相关单位的负责同志约10人列席会议。会议由上海市科委主任李逸平主持。
会议审议通过了由上海市中国工程院院士咨询与学术活动中心2003年度工作报告和2004年度工作要点；审议确定了第三届合作委员会成员名单。
杜祥琬副院长和严隽琪副市长在合作委员会会议上分别做了重要讲话。
杜祥琬副院长在讲话中积极评价了“中心”过去一年中的工作，并介绍了中国工程院近期开展的重要工作的进展情况。他说在院士相对集中的省市或地区，建立院士咨询与学术中心，是发挥院士群体作用的一种有效形式；地方政府和院士的支持是“中心”工作取得成绩的重要保障和依托；国家与地方科技、经济社会发展的客观需求是“中心”发挥作用的根本动力；活动内容和形式上的不断创新是“中心”更富有生气和凝聚力的保证。
严隽琪副市长在讲话中充分肯定了上海与工程院三年来的合作取得的成果，“中心”工作进展明显。科学发展观的提出和上海科教兴市战略的实施，为“院地合作”开辟了更加广阔的空间；“院地合作”要进一步完善工作模式，为实现全面、紧密、高效、互惠的合作提供机制保证；作为“院地合作”的执行机构，要进一步加强自身建设，切实发挥好服务于“院地合作”的载体作用。
各位委员也对“中心”2003年工作给予了充分肯定，认为“中心”一年来的工作扎实、步骤有序、服务到位、安排合理、效果显著，为政府部门的科学、民主决策做出了贡献，在实现科学发展观过程中发挥了积极的作用。
与会的各位领导和委员对“中心”下阶段的工作进行了讨论，并提出了希望与建议：
1.不断优化工作模式，进一步加强与政府有关职能部门的联系、用完善的机制与体制来集聚院士的智慧，充分发挥多学科与跨部门的优势。
2.咨询项目与学术活动选题，要面向经济建设主战场、紧密联系产业发展，为上海经济社会可持续发展的重要问题的决策提供咨询，如能源结构、城市建设与安全运营等。
3.积极参与2004年“院地”合作举办的“世界工程师大会”、“上海国际工业博览会”等大型活动，落实 “重大工程成就展暨论坛”、“工博会”院士圆桌会议、“工博会”评奖等工作。
4.“院士沙龙”等学术活动要针对热点、焦点问题展开深层次的研讨，形成深化的专题报告，强化实际效果。
5.要适度开展科普活动，特别是针对青少年的以传播科学知识、弘扬科学精神，倡导献身科学的活动。
6.尽快征询委员对“中心”章程的修改意见，完成章程修订工作。
在本次合作委员会会议上，杜祥琬副院长和严隽琪副市长还共同点击开通了“中心”网站。