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【中国科学报】我科学家构建密度最高对虾遗传连锁图谱

发布时间: 2016-03-21


文章来源:中国科学报 廖洋    

记者3月19日从中科院海洋研究所获悉,海洋动物生殖与遗传工程课题组利用高通量测序技术,对凡纳滨对虾的基因组进行了探查分析,并在此基础上成功构建全球标记密度最高的对虾遗传连锁图谱。相关成果近日发表在《科学报告》上。

在基因组探查的基础上,研究团队对一个人工选育的全同胞家系的父母本和205个子代进行高通量测序文库构建和简化基因组测序。最终构建的图谱包含44个连锁群,与凡纳滨对虾单倍体染色体数目一致,整合图谱中含有标记6146个,总图距4271.43厘米,标记间平均图距0.7厘米。该团队还利用该图谱成功定位了11个体长相关和7个体重相关的QTL,为推动凡纳滨对虾的分子标记辅助选育研究和全基因组选择育种研究提供了重要资源。

目前,该团队正进行凡纳滨对虾全基因组序列的测定和组装工作。利用基因组Survey组装的基因组序列数据和BAC末端测序数据,已完成遗传图谱、基因组组装以及BAC克隆的初步整合,为后续的全基因组序列组装和重要基因的定位打下了坚实基础。

(原载于《中国科学报》 2016-03-21 第4版 综合)




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